1986年至2005年，根据改革开放和林业管理的相关政策，全市先后进行了行政体制、经营管护和集体林权等方面的系列改革。分别实施十年绿化美化通化大地、百万亩红松阔叶林、退耕还林等重点林业工程。在打击毁林犯罪、野生动物保护、森林病虫害预测与防治和森林植物检疫方面取得显著成果。适时开展森林资源综合开发利用工程，并相继培育三大优势产业和五大接续产业。2004年，通化市实现连续50年无重大森林火灾目标。至2005年末，全市完成各类造林12 200公顷，森林覆被率62.9%，活立木总蓄积6 933万立方米。拥有1处国家级森林自然保护区，2处省级森林自然保护区，5处国家级森林公园，实现林业总产值29.5亿元，为全市经济的可持续发展奠定坚实基础。

　　第一节  通化市林业局

　　1986年，通化市林业局内设人秘、林业政策、营林、资源林场、计划财务科室。编制20人，实有20人。6月，设立市森林防火办公室。10月，设立林保科。编制30人，实有27人。1989年，设立审计科、监察科。编制20人，实有27人。1992年，设立科技科，内设科室增至9个。编制26人，实有26人。1995年，内设办公室、林保科、营林科、计划财务科。编制21人，其中工勤编2人，实有21人。2001年，编制18人，其中行政编16人，工勤编2人，实有18人。2005年，内设办公室、营林科、计划财务科、林保科（加挂森林防火办公室牌子）。编制18人，其中行政编16人，工勤编2人，实有18人。

　　第二节  直属事业单位

　　通化市森林病虫容防治检疫站　主要职能是负责全市森林病虫鼠害防治和森林植物检疫的监督、管理和指导。科级建制，财政全额拨款事业单位。1986年，编制5人，实有5人，至2005年。

　　通化市木材检查总站　主要职能是负责全市木材检查站管理；木材运输和木材经营加工单位监督、检查、管理。科级建制，财政全额拨款事业单位。1986年，编制5人，实有5人。1988年，拨2名编制给省林业厅驻通化市林业局森林资源监督专员办事处，编制3人，实有3人。2001年，与省林业厅驻通化市林业局森林资源监督专员办事处、通化市林业职工技术培训班合并组建通化市林政稽查支队。

　　通化市绿化办公室　主要职能是负责全市全民义务植树、四旁绿化、城乡绿化及栽花种草的组织协调和管理。科级建制，财政全额拨款事业单位。1989年5月31日成立。编制5人，实有5人，至2005年。

　　通化市林木种子管理站　主要职能是负责全市林木种子、苗木的计划、生产、管理和销售。科级建制，财政全额拨款事业单位。1987年3月10日成立。编制5人，实有5人，至2005年。

　　通化市林业技术推广总站　主要职能是负责全市林业科研、林业科学技术推广和应用。科级建制，财政全额拨款事业单位。1987年3月10日成立。编制10人，实有6人。2005年，编制10人，实有10人。

　　通化市林业职工技术培训班　主要职能是负责全市林业系统基层单位的业务和专业技术培训。科级建制，财政全额拨款事业单位。1987年2月14日成立。编制20人，实有15人。1995年，编制15人，调入防火电台5人，执行编制5人，实有5人。2001年，与森林资源监督专员办事处、木材检查总站合并成立通化市林政稽查支队。

　　通化市林业中心派出所　主要职能是管理辖区内的森林资源，查处、打击毁林犯罪案件。科级建制，财政全额拨款事业单位。1994年12月29日成立。编制10人，实有10人，人员编制纳入公安序列，至2005年。

　　通化市森林防火电台通讯管理站　主要职能是负责全市森林防火和林业公安通讯联络；各种通讯设施设备管理；无线电人员的管理和培训。科级建制，财政全额拨款事业单位。1995年成立。编制5人，从林业职工技术培训班调剂解决，实有5人，至2005年。

　　吉林省林业厅驻通化市林业局资源监督专员办事处　主要职能是对通化市森林资源培育、管理、开发、利用进行全过程监督、检查与管理。县级建制，市财政全额拨款事业单位。1988年12月13日成立。编制5人，实有5人。2001年，省林业厅驻通化市林业局森林资源监督专员办事处与木材检查总站、林业职工技术培训班合并成立林政稽查支队。2004年11月24日，恢复吉林省林业厅驻通化市森林资源监督专员办事处，县级建制，市财政全额拨款。事业编5人，实有5人，至2005年。

　　通化市林政稽查支队　主要职能是负责查处全市破坏森林资源案件和林政案件；负责林权、林地、木材加工、运输管理。副县级建制，财政全额拨款事业单位。2001年成立。编制13人，实有13人。2004年，改为科级建制，编制8人，至2005年。

　　通化市林业职工中专　主要任务是负责全市林业职工的在职培训和提高。1988年5月16日，由原浑江市林业职工中专整体划归通化市，改为通化市林业职工中专。县级建制，育林基金拨款事业单位。编制46人，实有46人。2001年，林业职工中专和林业职工技术培训班的职能合并，组建林业职工技术培训学校。编制38人，实有38人。2003年，调剂给吉林哈泥省级自然保护区管理局编制5人，调整后编制33人，执行编制28人。2005年，编制33人，实有33人。

　　通化市林场（苗圃）　主要业务是负责市区国有林的建设、管理、开发和利用。科级建制，自收自支事业单位。1986年，实有人数92人。1995年，核定事业编制80人，实有80人，至2005年。

　　吉林哈泥省级自然保护区管理局　主要职能是依法保护辖区内的森林、湿地等资源；打击破坏湿地生态系统、森林资源和乱捕滥猎、乱采滥挖野生动植物资源的违法行为。副县级建制，财政全额拨款事业单位。2003年3月10日建立。核定事业编制10人，实有10人，至2005年。

　　通化市野生动植物保护管理总站　主要职能是依法对全市野生动植物资源进行保护与管理。科级建制，自有资金开资的事业单位。2002年3月18日成立。核定事业编制3人，实有3人，至2005年。